隨著自閉癥孩子學習的發(fā)展，治療會進入不同階段。雖然各個階段并非截然不同，但自閉癥治療仍可分為三個階段：

1、自閉癥治療的開始階段主要是逐漸了解孩子

建立溫暖、快樂和具有強化作用的社會關(guān)系至關(guān)重要。為了實現(xiàn)這一目標，第一個月的治療重點在于，通過游戲和無條件發(fā)放強化物來確定強化物。通過營造積極的氛圍，使孩子更愿意服從教學安排，治療進展會因此更快，掙扎和破壞性行為會因此更少。

了解孩子的好惡，明了其長處和短處十分重要?！皩W會學習”（Learning to?leam）也是開始階段的關(guān)鍵成分。必須讓自閉癥孩子知道，符合要求就會得到即時、頻繁的獎賞。要學習的技能包括怎樣安坐聽講，怎樣在教學情境中專注于任務，對指令做出反應，學習如何處理反饋，理解因果關(guān)系等。這階段是為學習概念和技能做準備的階段。

2、自閉癥治療的中級階段包括學習具體的溝通、游戲、自理和社交技能

要將復雜的概念分解成一系列可系統(tǒng)教授的步驟，要將抽象的概念轉(zhuǎn)化成具體的實例。在孩子學習課程的過程中，要對課程進行個別化調(diào)整，以滿足孩子的需要。雖然開始時目標在于迅速促進學生技能的發(fā)展，但長期目標在于提高學生的學習能力和在自然環(huán)境中的功能。因此，為實現(xiàn)長期目標，治療應該盡可能自然而不影響孩子的學習速度。應該讓孩子參加游戲聚會和其他社交活動或社區(qū)活動。在這一階段，孩子通常進入學校情境。

3、在自閉癥治療的高級階段，要使治療日益自然，更能泛化到日常環(huán)境中

這一階段的重中之重在于，發(fā)展較為微妙的社交、游戲、情感、認知和溝通技能。完全融入自然的學習環(huán)境（也就是學校）也在這一階段。

在自閉癥治療的三個階段中，必須不斷評估治療的有效性。治療師要每天手機與所教的課程和行為相關(guān)的資料，并定期舉行團隊會議，討論治療的有效性，以及如何改進課程。建議拍下自閉癥孩子在家生活和訓練的情況，每月至少一次。